引起新生儿呕吐的疾病很多，如喂养不当、胃粘膜受刺激、胃肠道功能失调、肠道内外感染性疾病、中枢神经系统疾和遗传代谢性疾病、胃肠道发育畸形等，都可以引起新生儿呕吐。有些疾病，如胃穿孔、迷走血管压迫食管、环形胰腺、消化道重复症、嵌顿疝、肠套叠、阑尾炎等，也可以引起呕吐。
呕吐中枢位于延髓第四脑室基底部，传入神经主要为迷走神经、内脏神经、前庭神经、舌咽神经、视神经和嗅神经。传出神经为迷走神经、内脏神经、膈神经、腹肌脊神经、舌咽神经等。来自胃肠道病变部位和其他脏器的传入冲动刺激了呕吐中枢，反射性地引起胃、膈肌、腹肌以及腭、会厌等一系列的共济运动，从而形成了呕吐动作。呕吐中枢邻近呼吸中枢、自主神经中枢、涎核和前庭核，故在呕吐前和呕吐时常伴有面色苍白、出汗、多涎、脉搏和呼吸频率改变等现象。
新生儿比儿童更容易发生呕吐，引起新生儿呕吐的常见原因和临床表现与其他年龄组小儿有所不同，主要与新生儿的特点有关：①新生儿食管较松弛，胃容量小，呈水平位，幽门括约肌发育较好而贲门括约肌发育差，肠道蠕动的神经调节功能较差，腹腔压力较高等，均为新生儿容易出现呕吐的解剖生理原因;②胚胎时期各脏器分化和发育的异常，尤其是前、中、后肠的异常，容易造成消化道的畸形，使摄入的食物或消化道分泌物不能顺利通过肠道，逆行从口腔排出，形成呕吐;③胎儿出生时的刺激，如吞咽了大量的羊水、血液、以及出生后内外环境的急剧变化，也容易诱发新生儿呕吐;④新生儿呕吐中枢发育不完善，容易受全身炎症或代谢障碍产生的毒素刺激引起呕吐。
出生12周后发生呕吐，全身情况很好的，常常因喂养不当引起。小儿食量已增加，而母奶不足或牛奶过稀时，小儿饥饿，吸奶时咽下大量空气，或人工喂养时奶头开孔过小、过大，牛奶不充满奶头，都可以让小儿吞入空气，当咽入的大量空气从胃内排出时便发生呕吐。此外，牛奶过热、过冷、量过多或吸奶后翻动小儿等也会引起呕吐，有时呕吐可呈喷射状。只要注意喂养方法，吸奶后竖抱起小儿轻拍背部，待至嗳出吞入空气后再半卧，就不会发生呕吐。由于贲门松弛引起的呕吐，吸奶后予以竖抱，日龄稍大后，牛奶中加些奶糕，使奶液变稠厚些，能减少呕吐，随着日龄增长，能逐步恢复。如果胃出口(幽门)处肌肉痉挛，乳汁不易通过，也会发生呕吐，吸奶前给予解痉药物会有效。因新生儿的胃游离度和活动度大，进食后会发生胃扭转而呕吐，可于吸奶后身体稍抬高或取右侧卧位加以预防。对于小儿喂饱后不久吐出少量乳汁，一般情况良好，食欲正常，吐后不啼哭，亦不伴有其他任何症状和体征，通俗称为溢奶，属于正常现象。
出生23周后开始呕吐，每天数次，逐渐频繁并发展为喷射性，每次进食后半小时左右就发生剧烈呕吐，吐出量有时比进入量还多，吐出物无胆汁，吐后食欲仍正常，因长期持续呕吐而逐渐消瘦的，可能为先天性幽门肥大性狭窄。本病在男婴多见，进食时在腹部可见到胃蠕动小，有时在右上腹可模到象橄榄大小的硬块即是肥大的幽门，一般需要手术治疗。如果小儿经常发生便秘，35天排便一次，而且必须经常灌肠才能排出，否则就出现明显腹胀、呕吐，这时应考虑先天性巨结肠的可能，应由医生进一步通过X光摄片等明确诊断，随后进行根治性手术。
新生儿在胎内、出生时、出生后都很容易感染败血症、肺炎、脑膜炎等，呕吐可以为这些疾病的症状之一，因此，新生儿任何时期出现呕吐，伴有上述这些疾病的相应症状，或全身情况差时，应及时就诊治疗。
总之，引起新生儿呕吐原因很多，只有排除各种先天性畸形等外科疾病、感染性疾病，再结合小儿全身情况，才能考虑是否由于喂养不当所引起，否则容易延误治疗，甚至影响生命安全。
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